自2017年以来，中心与毛里求斯籍科学家HudaaNeetoo在农业有机肥料领域开展双边合作，解决堆肥样品中功能微生物菌种分离鉴定的技术问题。该双边合作，一方面通过可培养阶段的分离筛选获得的活性单株功能菌株，保存编入中心的功能益生菌资源库，另一方面通过非培养技术如微生物群落二代测序，获得堆肥过程中有机肥料的功能微生物群落信息，对指导加快堆肥腐熟，缩短堆肥周期，抑制有害细菌生长具有重要的科学意义。该双边合作对毛里求斯国家在促进其种植业、养殖业方面的科学发展，控制畜牧业成本，增加经济效益，改善生态环境等方面具有重要的科学指导价值，相关研究成果合作发表SCI论文1篇。
